プレイバックPart１　作：天

～これまでの『遊戯王戦記』～

デュエル・アカデミアの入学試験を受けるため『首飾りの国』から『秤の国』王都にやってきた少年・武藤ユーイは、ひょんなことから貴族の子弟に絡まれていた大衆食堂の娘・チヨを助け、デュエルをすることになる。

相手は『秤の国』の七大貴族『七星候（セブンスターズ）』の一角はタイタン家の御曹司・シクス。凡人以下の魔力しか持たないユーイは下級モンスターしか召喚することができず、強大な魔力を持つシクスの【デーモン】デッキに苦戦する。しかし少ない魔力でも強力なモンスターを特殊召喚できるリンク召喚で《ブリッツ・マジシャン》を召喚し、その効果によるコンボで見事勝利を収める。

その後、チヨと仲良くなったユーイはこの世界とは別の世界がありそこからやってきた異世界人が存在することを知り、自分が１年前より前の記憶を失った記憶喪失であることを明かす。

数日後、いよいよデュエル・アカデミアの入学試験が開始され、生徒会メンバーや同じ受験生達と出会いながらユーイは実技試験へと挑む。
実技試験は実際にデュエルを行う方式であり、ユーイの相手は『アカデミアの魔女』と呼ばれ畏れられる超一流の実力者・クローディア。その圧倒的な力の前に大きな実力の隔たりを感じるユーイであったが、再び《ブリッツ・マジシャン》のリンク召喚に成功し、全てをかけた一発逆転のコンボで辛くも勝利する。
その勝利によりユーイは入学試験に合格するとともに一躍王都中に名前を知られることになる。

しかし、記憶喪失のユーイを保護し新しくデュエル・アカデミアの講師となった響ヒスイはそのデュエルを茶番と評しクローディアを問い詰める。それにクローディアは「そのうちこの王都で闘いが起こり、ユーイもその闘いの中心にいることになる」と告げる。ヒスイは逆に「過保護なままではユーイを守ることはできない」と釘を刺される。

さらに数日が経ったある日、チヨの働く大衆食堂『ふぁらお亭』からの帰り道、覆面をした謎の女性決闘者に襲撃されデュエルすることになる。
相手の正体も分からぬままデュエルするユーイだったが、突如としてその身を異変が襲う。性格も魔力の質すらも変わる謎の変貌を遂げるユーイ。さらには白紙のカードに新たなモンスターを生み出す『異能（スキル）』という謎の特殊能力で《Ｅ・ＨＥＲＯ アクエリアス》を生み出す。しかしデュエルには美少女決闘者の融合召喚した《スターヴ・ヴェノム・フュージョン・ドラゴン》の力により敗れる。

実は美少女決闘者の正体はデュエル・アカデミアの生徒会会長・影丸ユウリであった。
ユウリは過去に占い師のミヅキから『将来、王になる人物と結ばれる』という予言を受けており、それを強く信じていた。と同時にある人物からその証となる白紙のカードを渡されており、そのカードがユーイを主と認めたことにより彼を自らの結ばれる相手であると確信する。

一方のユーイは、この敗北によりもっと力を付けいつか必ず彼女にリベンジするという目標を得ることになった。

そして遂にデュエル・アカデミアは新学期を迎えようとしていた。
新たな出会いと闘いがユーイを待ち受けている・・・！